在云南农村，若想在永久基本农田上建房，必须遵守《土地管理法》的相关规定。根据该法，农村村民建住宅应当符合乡镇土地利用总体规划和村庄规划，不得占用永久基本农田。未经批准擅自建房可能面临拆除等严厉处罚。同时，需注意在农村集体土地上建房需报经集体经济组织批准同意。
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关于在农田上建房的问题，处理方法包括补办手续、拆除违建或缴纳罚款等。具体采取哪种方式，需结合当地政策、土地利用规划及建房具体情况综合考虑。为确保自身权益，建议咨询当地相关部门或专业律师。
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在云南农村，若未申请建房便占用土地，可能构成违法。处理方式包括：首先，如果符合“一户一宅”等条件，可以尝试补办审批手续；其次，如果是非法占用，应退还土地，并可能面临拆除、没收或罚款等后果；最后，建议咨询专业法律人士，了解具体情况下的合法操作方式，以确保自身权益不受损失。